种植屋面的防水层不但要满足一般屋面防水层的要求，还应具有耐腐蚀、耐霉烂、耐穿刺的要求，因为种植屋面常处于潮湿环境，当温度适当时，微生物、细菌生长会使防水层霉烂，植物生长时，根系会穿刺防水层，所以防水层应是耐穿刺能力强，并有足够厚度的材料，如PVC防水卷材、PE防水卷材等，并采取焊接搭接使接缝完善可靠，如采用合成高分子橡胶类卷材，应有保证接缝可靠性的措施。为了保证防水层的耐久性，柔性防水层上还应设置一道细石混凝土的保护层。

     种植屋面应具有足够的排水坡度，在四周挡墙下设置泄水孔，当雨水过多时，将水迅速排除，以免植物烂根。在泄水孔内部还应做好滤水装置，避免种植介质被水冲走。